癌症指數本身並不是一種診斷數值。升高可能代表有癌症，也可能沒有。有許多可能會造成癌症指數升高，例如：癌症、相關器官的發炎等等。 而正常也不代表就一定沒有癌症，但因為它的敏感度很高，所以一般自費健檢是用來篩檢潛在的癌症。因為癌症有一定的普及率，且對人們的危害很大，所以使用「寧可錯殺一百，不可放過一個」的篩檢工具。如果有發現不正常的跡象，則必須要做進一步檢查才能確認。
所有的癌症指數最最主要的功能是用來評估癌症的治療成果和追縱癌症是否復發。在治療前後，以及日後門診追縱時，醫師可能都會測量並比較它的數值。由於可以比較，所以較能準確地預測癌症的有無。
下列是健檢常見的癌症指數與相關器官：
CEA：大腸、胃
AFP：肝癌
PSA：攝護腺癌
CA15-3：乳癌
CA125：卵巢癌
CA19-9： 胰臟
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